Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms