Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms