Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6BO15054 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6BO15054 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms