Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAMP3O14828 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms