Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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