Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms