Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms