Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms