Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms