Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EME2A4GXA9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms