Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
DCAF1Q9Y4B6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCAF1Q9Y4B6 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms