Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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