Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms