Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms