Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNRC6BQ9UPQ9 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms