Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRPF3Q9ULD4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms