Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSEQ9UL01 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms