Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms