Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CGGBP1Q9UFW8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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