Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms