Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms