Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATAD3AQ9NVI7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms