Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREX1Q9NSU2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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