Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCC13Q9NSE7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms