Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PFDN4Q9NQP4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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