Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HMG20AQ9NP66 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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