Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms