Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4CQ9C0C4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms