Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CECR2Q9BXF3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CECR2Q9BXF3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms