Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms