Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms