Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms