Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms