Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms