Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms