Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRIQ1Q96JM4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms