Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms