Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms