Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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GCN1Q92616 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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GCN1Q92616 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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GCN1Q92616 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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GCN1Q92616 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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GCN1Q92616 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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GCN1Q92616 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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GCN1Q92616 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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GCN1Q92616 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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GCN1Q92616 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GCN1Q92616 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCN1Q92616 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCN1Q92616 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GCN1Q92616 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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