Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms