Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms