Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIEQ8NEW7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms