Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUMF1Q8NBK3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms