Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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