Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACE1Q8IYU2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms