Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms