Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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