Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms