Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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