Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC38Q5VT99 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms